纳米孔全长转录组--500元/6GB
一、产品介绍
纳米孔全长转录组测序技术，依托第三代纳米孔测序平台的核心优势，无需对RNA进行片段化、PCR扩增及拼接，可直接读取从5'端到3'端的完整转录本序列（最长可达10kb以上）。该技术完美规避了传统短读长测序的拼接偏差、异构体识别不完整、低丰度转录本漏检等痛点，能真实、全面地还原细胞内转录本的原始状态，为基因表达调控、可变剪接分析、新转录本挖掘等研究提供更精准、更高效的解决方案。
二、PB和纳米孔平台比较
二、国产纳米孔平台测试比较
三：国产纳米孔平台测试比较
ont为ONT平台测试，数据1和2为国产纳米孔平台测试
四、技术方案
①完善注释
三代：不同部位或时期组织分别提取RNA，等量混成1个RNA进行全长cDNA测序
多组织混样选择：不同发育阶段的组织或相同发育阶段的不同组织，同一组织的不同发育时期，甚至不同个体进行混样测序，侧
重于解决结构和功能分析。混样数量建议不超过4个，混样增多需增加测序数据量，且有可能掩盖低丰度的转录本 。
如比较关注某些特定基因，可对特定组织单独测序。比如开花相关基因，或者提升动物Y染色体注释，可以单独对该组织部位，花、
睾丸单独进行建库测序，提高其基因表达丰度的检测。
②差异转录组
三代：处理组和对照组分别做全长cDNA测序，每个组别3个重复
Ø 这样既可以分析组织间的差异，也可以分析对照和处理组间的差异；找出差异关键的基因或转录本，功能性研究，可以结合
多组学进行研究，并联合实际处理条件，研究动植物的胁迫，适应性驯化机制。
Ø 样本选择为同一物种的对照组和处理组。
Ø 也可以选择为不同物种的同一组织做比对分析，寻找性状相关差异基因或代谢通路。但是两个物种亲缘关系近。
③动态转录组
三代：不同时间/发育时期分别全长cDNA测序，每个组别3个重复
比较不同时间点/发育点的转录本情况，可变剪接的动态变化。
④构建转录组图谱
三代：不同组织部位，不同发育时期（尽可能全），每个样本3个重复，进行全长cNA测序
⑤其它注意事项
分析需要参考基因组。