泛基因组(Pan-genome)代表一个物种的全部遗传信息,包括核心基因(core genome)和非核心基因(dispensable / variable / accessory genome)。其中,核心基因为所有样本种都存在的基因,控制着生命体基本生物学功能和主要的表型特征;非核心基因为仅在单个样本或一部分样本中存在的基因,一般与物种对特定环境的适应性或特有的生物学特征相关,反映了物种的特性。 泛基因组逐渐取代单一参考基因组,将会成为研究动植物进化、选择与基因功能的“新标准”。本期我们整理了今年5月份前,在Nature和Nature Genetics顶刊发表
view more华命生物目前已成功完成50+物种的T2T基因组组装,物种涵盖动物、植物、昆虫及同源和异源多倍体等疑难物种,已有多个合作项目在顶级期刊发表和接收,欢迎有需要的老师垂询。联系方式:18371456025。 端粒到端粒(T2T)组装是基因组从头组装的终极目标。现有能够实现接近T2T组装的算法均依赖ONT超长(UL)数据,但ONT UL数据成本高昂且实验制备难度大,因此对于缺乏稳定细胞系的样本通常难以获取。 为了解决以上问题,耶鲁大学医学院的李恒老师近日推出hifiasm(ONT),并于2025年4月14日在预印版平台bioRxiv上线“Efficient near telom
view more华命生物目前已成功完成50+物种的T2T基因组组装,物种涵盖动物、植物、昆虫及同源和异源多倍体等疑难物种,已有多个合作项目在顶级期刊发表和接收,欢迎有需要的老师垂询。联系方式:18371456025。 自2001年人类基因组首次测序完成以来,获取高质量猿类基因组序列始终是人类遗传学界的核心任务。这些基因组的完整测序对重建人类基因组每个碱基对的演化历史至关重要。但由于猿类基因组的高度重复性,完整T2T组装始终未能实现。现有参考基因组在诸多复杂基因组区域仍缺乏序列完整解析。 2025年4月9日,来自全球的多个科学家团队合作,在顶级学术期刊
view more华命生物目前已成功完成50+物种的T2T基因组组装,物种涵盖动物、植物、昆虫及同源和异源多倍体等疑难物种,已有多个合作项目在顶级期刊发表和接收,欢迎有需要的老师垂询。联系方式:18371456025。 普通小麦(Triticum aestivum L.)是全球广泛种植的农作物,普通小麦基因组大小约15 Gb,包含三个亚基因组,其中重复序列占比超过85%,这使其成为植物基因组测序的重大挑战。2018年,国际小麦基因组测序联盟(IWGSC)首次发布了中国春(CS)的参考基因组,随着测序技术的进步,已有20多个普通小麦基因组完成组装。但这些基因组
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