兰花是被子植物中最大且最为多样化的科之一,石斛属(Dendrobium Sw.)是兰科三大属之一,包含约1800个物种。石斛属物种表现出高度多样化和复杂的形态,由于其观赏和药用价值,石斛在全球范围内引起了公众和研究人员的广泛关注和兴趣,成为许多国家和地区的重要经济植物。 最近,来自新加坡和中国的研究团队合作在著名期刊Nature Plants上面发表了名为《Pangeneric genome analyses reveal the evolution and diversity of the orchid
view more完整的遗传变异数据集是生物多样性基因组学研究的关键。长读长测序技术的快速发展,使组装高质量单倍型解析的参考基因组成为可能。然而,即使是单个个体完整的T2T基因组,因为无法充分代表一个种群或物种内的遗传多样性,仍可能会使下游分析产生偏差。通过将来自同一种群、物种或属的多个高质量基因组序列信息整合到单个参考基因组上,这些基因组比对集合组装而成的泛基因组能够克服代表性偏差问题。 近日,来自美国和意大利等多国的科学家团队,在著名期刊Nature Genetics上撰文发表了名为《Pangenome graphs and the
view more端粒到端粒(T2T)基因组组装代表了基因组测序和组装领域的一个重要的里程碑,它实现了从染色体的一个端粒到另一个端粒的完整序列的生成。人T2T基因组揭示了以前无法通过测序组装获取的未知区域。T2T基因组也已在重要作物如水稻、大豆和玉米等上获得,为着丝粒功能和进化以及其他基因组特征的研究提供了宝贵见解。 近日,来自默多克大学等地的研究团队在著名期刊Nature Genetics上发表了综述文章Unlocking plant genetics with telomere-to-telomere genome assemblies,在这篇综述中,研究人员讨论了复杂作物T2T基因组面临的挑战,如重
view more近日,多国的科学家团队一起,在Nature Genetics上撰文介绍“反刍动物T2T联盟(RT2T)”的开放性项目合作计划,该联盟旨在生成反刍动物(Ruminantia)众多物种完整的二倍体单倍型T2T基因组。但实际上,在该倡议文章发表之前,来自中国农业大学的李孟华教授团队联合合作单位,已经在BioRxiv平台上线了Telomere-to-telomere sheep genome assembly reveals new variants associated with wool fineness trait的预印文章,抢先一步发布了首个反刍动物绵羊T2T完整基因组
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