一、产品介绍 自2020年7月Nature上首次发表人类基因组完整的X染色体序列以来,T2T联盟致力于人类基因组的...
一、产品介绍 全基因组重测序(whole genome sequencing,WGS)是对已知基因组序列的物种进行...
野燕麦Avena fatua是与栽培燕麦 Avena sativa和不实野生燕麦A. sterilis密切相关的六倍体杂草,在全球农田中广泛分布,被认为是危害最严重的杂草之一。它具备极强的环境适应性和表型可塑性,能够耐受多种非生物和生物胁迫,并表现出显著的除草剂抗性。尽管其入侵性对农业生产造成严重损失,野燕麦仍蕴藏着丰富的抗病抗逆遗传资源。 河北大学杜会龙教授及其研究团队于2025年11月7日在国际著名期刊Nature Communications上发表了题为“Reference genome and population genomic analyses reve
转座子(TEs)是植物基因组的重要组成部分,能够在基因组中扩和移动,推动遗传变异和基因组进化。长末端重复逆转录转座子(LTR-retrotransposons)是植物中最常见的转座子类型,它们通过复制机制增加基因组拷贝数,并可能导致基因组大小的扩张。在多倍化过程中,TE 的活动和扩增对基因组变化起着关键作用。棉属(Gossypium)是研究多倍化和作物改良的典型模型,TE 在其基因组扩张、物种分化和驯化过程中发挥了重要作用。 西班牙研究团队于2025年10月27日在国际知名期刊Genome Biology上发表了一篇题为“Differential LTR‑retrotrans
燕麦Avena sativa是全球第七大谷物,因其高纤维含量对人类健康有益。尽管燕麦具有提高产量和可持续性种植的潜力,但由于其复杂的基因组结构,遗传改良进展较慢。燕麦是一种同种异体六倍体,包含A、C、D三个亚基因组,每个亚基因组大小在3Gb到4Gb之间。与许多其他谷物物种相比,燕麦的基因组研究仍处于早期阶段,对结构基因组多样性和基因表达变异性的研究仍然不足。 加拿大研究团队于2025年10月29日在国际著名期刊Nature上发表了一篇题目为“A pangenome and pantranscriptome of hexaploid oat”的研究论文,该研究通过组
着丝粒是染色体分离的重要结构,其序列和组成在不同植物中差异显著。除卫星重复序列外,转座元件(TEs)在着丝粒结构中也发挥关键作用。虽然模式植物研究较多,但多年生树种如杨树的着丝进化机制仍不清楚。随着长读长测序和 Hi-C 技术的发展,端粒到端粒(T2T)组装为解析植物着丝粒结构与演化提供了新契机。 南京林业大学的科研团队于2025年9月29日在期刊The Plant Journal上发表了一篇题目为“Haplotype-resolved telomere-to-telomere genome assembly of Populus lasiocarpa unveils ret
在基因组学与表观遗传学飞速发展的今天,T2T(端粒到端粒)基因组 作为新一代“完整地图”,正为生命科学研究带来前所未有的分辨率与准确性。而表观遗传机制,作为基因表达的“调控开关”,如何在更完整的基因组背景下被解读,已成为众多科研工作者关注的焦点。为此,华命生物与易基因联合推出T2T基因组与表观前沿技术解析与整合应用系列讲座,2025年11月5日至12月10日期间每周三14:00开播,从技术原理到实战案例,全面掌握T2T基因组与表观多组学研究路径! 01整体课程抢先看
植物T2T基因组篇 /Plant 1.茄子T2T基因组 【英文标题】A complete telomere-to-telomere genome assembly of Solanum melongena uncovers key regulators in pan-tissue anthocyanin biosynthesis 【发表期刊】Plant Communications 【发表时间】2025.09.23 【研究内容
一、植物T2T基因组篇 /Plant 1.梨单倍型T2T基因组 主要研究内容:作者采用PacBio HiFi、ONT ultra-long和Hi-C数据,通过hifiasm初步组装二倍体基因组的两个单倍型。随后利用Verkko和HiCanu的组装结果填补空缺区域及端粒区,最终每个单倍型被组装成17条染色体。其中分别有18.89和24.13 Mb区域此前未被成功组装。研究首次完成了亚洲梨代表品种‘砀山酥梨’(DS)和欧洲梨代表品种‘Max Red Bartlett’(MRB)的单倍型分型T2T基因组,为梨遗传变异机制提供了新见解,并将加
那些曾被称作"基因组暗物质"的迷雾,在Hi-C数据的星轨中逐渐显影。从第一节课的"什么是真正的T2T",到最后一场关于"T2T基因组特色分析"的探讨,我们共同完成了对生命完整性的温柔丈量。《T2T基因组学系列线上公开课》课程终章不是句点而是启动子——您构建的认知质粒正穿梭在学术宇宙,那些被激发的科研噬菌体将持续感染未知领域。 一、问答环节 1.四倍体,基因组接近2G,90条以上染色体,T2T有没有可能 答:如果是异源四倍体,比如油菜和棉花这种,是没有任何