一、产品介绍 全基因组重测序(whole genome sequencing,WGS)是对已知基因组序列的物种进行...
一、产品介绍 自2020年7月Nature上首次发表人类基因组完整的X染色体序列以来,T2T联盟致力于人类基因组的...
一、产品介绍 泛基因组(Pan-genome)代表一个物种的全部遗传信息,包括核心基因(core genome)和...
多倍化(WGD)在被子植物中普遍存在,并对其演化起着关键作用。多倍体可通过异源多倍化或同源多倍化形成,由于染色体的大规模重排和亲本谱系的可能灭绝,识别经历过再二倍化的古老异源多倍化事件并区分其亚基因组具有挑战性。再二倍化的异源多倍体需要基于基因含量的残留差异、表达偏好和重复DNA特征来推断亚基因组。但当古老异源多倍体呈现高度同质化的亚基因组时,这些方法便难以奏效。因此对于古老异源多倍体亚基因组的对比性演化及其在高等分类类群中创新性状形成、物种多样化及明显生态位分化等方面的贡献,目前仍缺乏深入研究。 近日,四川大学/兰州大学刘建全教授和四川大学马涛教授团队,在国际著名期刊《Nature C
燕麦(Avena sativa)是全球第七大粮食作物,广泛应用于食品和饲料中,且因其高营养价值和较强的干旱适应性而具有重要的农业价值。燕麦属(Avena)包括约30个公认物种,涵盖二倍体(AA或CC)、四倍体(CCDD或AABB)和六倍体(AACCDD)等不同类型,展现出丰富的遗传多样性。尽管燕麦在全球农业中占据重要地位,但其基因组复杂、重复序列丰富,且研究资源有限,难以全面解析其遗传背景和进化历程。 河北大学生命科学学院杜会龙教授及其科研团队于2025年8月20号在著名期刊《Nature Genetics》上发表了一篇名为“Super-pangeno
拟南芥(Arabidopsis thaliana)为十字花科、拟南芥属一年生草本植物,因其基因组较小以及丰富的遗传多样性,成为了研究植物基因组演化和适应性的关键模型。然而,传统基因组学分析方法依赖于将短序列比对到单一参考基因组,这导致了对基因变异的理解偏向于简单、易对齐的区域,忽视了复杂的结构变异和转座元件的影响。 奥地利科学院的Magnus Nordborg及其科研团队于2025年8月19号在著名期刊《Nature Genetics》上发表了一篇名为“A comparison of 27 Arabidopsis thaliana genomes and
栽培莴苣(Lactuca sativa)属于菊科莴苣属,是全球广泛种植和消费的重要蔬菜,富含对人类健康有益的植物营养素。其驯化起源于约4000年前高加索地区的野生刺莴苣(L. serriola)。通过多次驯化和多样化,莴苣发展出了脆叶型、黄油型、罗马莴苣型等多种形态。近年来,基因组研究揭示了莴苣驯化过程中的遗传变异,但结构变异(SVs)及其对驯化性状的贡献仍然不完全明确。 新加坡国立大学沈丽莎研究员及其科研团队于2025年8月6日在著名期刊《Nature Communications》上发表了一篇名为“Lactuca super-pangenome provid
那些曾被称作"基因组暗物质"的迷雾,在Hi-C数据的星轨中逐渐显影。从第一节课的"什么是真正的T2T",到最后一场关于"T2T基因组特色分析"的探讨,我们共同完成了对生命完整性的温柔丈量。《T2T基因组学系列线上公开课》课程终章不是句点而是启动子——您构建的认知质粒正穿梭在学术宇宙,那些被激发的科研噬菌体将持续感染未知领域。 一、问答环节 1.四倍体,基因组接近2G,90条以上染色体,T2T有没有可能 答:如果是异源四倍体,比如油菜和棉花这种,是没有任何
我们曾以为,基因组是一本被翻旧的书,总有些页码模糊不清。直到T2T技术轻轻抚平了那些褶皱,端粒与着丝粒的迷雾被拨开,gap里的暗物质开始低语,那些曾被称作"垃圾"的序列,正用古老的密码讲述着新的故事。 这个夏天,让我们陪你走向基因组的最后边疆。华命生物《T2T基因组学系列线上公开课》即将启程,六场精华直播,助您抢占基因组学研究制高点! 一、课程整体安排 二:课程亮点 ☑ 权威解析:区分T2T基因组、near T2T与高质量参考基因组的
华命生物目前已成功完成60+物种的T2T基因组组装,物种涵盖动物、植物、昆虫及同源和异源多倍体等疑难物种,已有多个合作项目在顶级期刊发表和接收,欢迎有需要的老师垂询。联系方式:18371456025。 华命生物全面汇总了动植物T2T基因组文章,本期我们分享130+已发表的植物T2T基因组文献合集,我们不仅有按照时间排序的最全文献原文汇总,更贴心的整理了每篇文章的研究物种、测序策略、组装水平、基因组大小等内容,一键对应您感兴趣的文章,免费获取哦~除此之外,我们整理过程中可能会有遗漏,将会不定期整理更新T2T基因组文章,同时欢迎感兴趣的老师通过文末方式加入华命生物科研交流
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