一、产品介绍 自2020年7月Nature上首次发表人类基因组完整的X染色体序列以来,T2T联盟致力于人类基因组的...
一、产品介绍 全基因组重测序(whole genome sequencing,WGS)是对已知基因组序列的物种进行...
着丝粒是染色体上负责姐妹染色单体分离的关键区域,其功能在真核生物中广泛保守,但DNA序列的组成在不同物种间存在显著差异。植物的着丝粒较为多样,通常由高拷贝的串联重复(TR)单元组成,这些重复序列有时形成高阶重复(HOR)。如拟南芥和黄豆等植物的着丝粒中存在大量卫星重复序列,但在一些禾草和茄科植物中着丝粒的结构则由长末端重复反转录转座子(LTR-RTs)主导。 杨猛教授及其研究团队于2025年9月15日在著名期刊Horticulture Research上发表了题为“Structural composition and evolution of jujube centromer
茄子 (Solanum melongena) 是全球重要的茄科蔬菜作物,年产量超过5900万吨,中国和印度为主要生产国。与多起源于新大陆的茄科作物不同,茄子起源于亚洲,在系统发育上与番茄、马铃薯等作物存在较大差异。栽培种S.melongena与其直接野生祖先S.insanum及近缘种S.incanum构成明确的演化谱系,蕴含丰富的遗传多样性。 国外研究团队于2025年11月11日在Nature Communications上发表了题为“Graph-based pangenomes and pan-phenome provide a cornerstone for eggpla
真核生物基因组中约一半由重复序列组成,卫星DNA是其中重要类型,由串联重复序列构成,主要分布在着丝粒、着丝粒旁和端粒区域,维持染色体稳定并参与细胞分裂。小鼠基因组中卫星DNA约占11%,其中着丝粒由120 bp的MiSats(minor satellite repeats)构成,着丝粒旁区域由234 bp的MaSats(major satellite repeats)组成,整体高度同质。虽然小鼠是重要的遗传与生物医学研究模型,但其这些高重复区域长期缺乏完整注释。 国外研究团队于2025年11月3日在国际著名期刊Nature Communications上发表了一篇标题为“Ge
野燕麦Avena fatua是与栽培燕麦 Avena sativa和不实野生燕麦A. sterilis密切相关的六倍体杂草,在全球农田中广泛分布,被认为是危害最严重的杂草之一。它具备极强的环境适应性和表型可塑性,能够耐受多种非生物和生物胁迫,并表现出显著的除草剂抗性。尽管其入侵性对农业生产造成严重损失,野燕麦仍蕴藏着丰富的抗病抗逆遗传资源。 河北大学杜会龙教授及其研究团队于2025年11月7日在国际著名期刊Nature Communications上发表了题为“Reference genome and population genomic analyses reve
在基因组学与表观遗传学飞速发展的今天,T2T(端粒到端粒)基因组 作为新一代“完整地图”,正为生命科学研究带来前所未有的分辨率与准确性。而表观遗传机制,作为基因表达的“调控开关”,如何在更完整的基因组背景下被解读,已成为众多科研工作者关注的焦点。为此,华命生物与易基因联合推出T2T基因组与表观前沿技术解析与整合应用系列讲座,2025年11月5日至12月10日期间每周三14:00开播,从技术原理到实战案例,全面掌握T2T基因组与表观多组学研究路径! 01整体课程抢先看
植物T2T基因组篇 /Plant 1.茄子T2T基因组 【英文标题】A complete telomere-to-telomere genome assembly of Solanum melongena uncovers key regulators in pan-tissue anthocyanin biosynthesis 【发表期刊】Plant Communications 【发表时间】2025.09.23 【研究内容
一、植物T2T基因组篇 /Plant 1.梨单倍型T2T基因组 主要研究内容:作者采用PacBio HiFi、ONT ultra-long和Hi-C数据,通过hifiasm初步组装二倍体基因组的两个单倍型。随后利用Verkko和HiCanu的组装结果填补空缺区域及端粒区,最终每个单倍型被组装成17条染色体。其中分别有18.89和24.13 Mb区域此前未被成功组装。研究首次完成了亚洲梨代表品种‘砀山酥梨’(DS)和欧洲梨代表品种‘Max Red Bartlett’(MRB)的单倍型分型T2T基因组,为梨遗传变异机制提供了新见解,并将加
那些曾被称作"基因组暗物质"的迷雾,在Hi-C数据的星轨中逐渐显影。从第一节课的"什么是真正的T2T",到最后一场关于"T2T基因组特色分析"的探讨,我们共同完成了对生命完整性的温柔丈量。《T2T基因组学系列线上公开课》课程终章不是句点而是启动子——您构建的认知质粒正穿梭在学术宇宙,那些被激发的科研噬菌体将持续感染未知领域。 一、问答环节 1.四倍体,基因组接近2G,90条以上染色体,T2T有没有可能 答:如果是异源四倍体,比如油菜和棉花这种,是没有任何