植物T2T基因组
一、产品介绍 自2020年7月Nature上首次发表人类基因组完整的X染色体序列以来,T2T联盟致力于人类基因组的...
茶是重要的全球经济作物,但长期驯化与育种过程导致栽培茶树遗传多样性降低,形成明显遗传瓶颈。相较之下,野生近缘种具有更丰富的遗传变异,是改良茶树性状的重要资源。结构变异在植物进化和农艺性状形成中发挥关键作用,但受限于单一参考基因组和短读长测序,茶树SV研究仍不充分,尤其缺乏对野生近缘种的系统解析。 安徽农业大学韦朝领研究团队于2025年12月6日在国际著名期刊Nature Communication上发表标题为“Pangenome analyses of tea plants reveal structural variations driving gene expressio
view more阿纳鲳鲹(Trachinotus anak)是我国重要的海水养殖经济鱼类,主要分布于西太平洋热带和亚热带海域。该物种具有肉质细嫩、生长迅速和环境适应性强等优点,近年来在我国东南沿海地区养殖规模迅速扩大,年产量居海水养殖鱼类前列。尽管已有阿纳鲳鲹基因组组装报道,但现有版本仍存在缺口多、端粒序列不完整等问题,限制了分子育种和功能基因组学研究的深入开展。 广东海洋大学水产学院陈华谱研究团队近日在Scientific Data上发表标题为“Telomere-to-telomere haplotype-resolved genome assembly of a female oyste
view more阿纳鲳鲹(Trachinotus anak)是我国重要的海水养殖经济鱼类,主要分布于西太平洋热带和亚热带海域。该物种具有肉质细嫩、生长迅速和环境适应性强等优点,近年来在我国东南沿海地区养殖规模迅速扩大,年产量居海水养殖鱼类前列。尽管已有阿纳鲳鲹基因组组装报道,但现有版本仍存在缺口多、端粒序列不完整等问题,限制了分子育种和功能基因组学研究的深入开展。 广东海洋大学水产学院陈华谱研究团队近日在Scientific Data上发表标题为“Telomere-to-telomere haplotype-resolved genome assembly of a female oyste
view more转座元件现已证实是驱动基因组进化、调控基因表达与表型形成的关键因素,这类可移动遗传元件可通过引入顺式调控元件等方式广泛影响邻近基因活性。油菜作为重要的油料作物,其异源四倍体基因组和丰富的育种历史为研究转座元件的功能与进化提供了理想体系。然而,在物种水平上,油菜转座元件多态性的全貌、其对基因网络的调控机制及其与农艺性状的关联仍缺乏系统性探索。 华中农业大学联合崖州湾国家实验室于2025年12月8日在国际知名期刊 Advanced Science上发表了标题为“A Pan-TE Map Reveals the Important Role of Tr
view more在基因组学与表观遗传学飞速发展的今天,T2T(端粒到端粒)基因组 作为新一代“完整地图”,正为生命科学研究带来前所未有的分辨率与准确性。而表观遗传机制,作为基因表达的“调控开关”,如何在更完整的基因组背景下被解读,已成为众多科研工作者关注的焦点。为此,华命生物与易基因联合推出T2T基因组与表观前沿技术解析与整合应用系列讲座,2025年11月5日至12月10日期间每周三14:00开播,从技术原理到实战案例,全面掌握T2T基因组与表观多组学研究路径! 01整体课程抢先看
view more植物T2T基因组篇 /Plant 1.茄子T2T基因组 【英文标题】A complete telomere-to-telomere genome assembly of Solanum melongena uncovers key regulators in pan-tissue anthocyanin biosynthesis 【发表期刊】Plant Communications 【发表时间】2025.09.23 【研究内容
view more一、植物T2T基因组篇 /Plant 1.梨单倍型T2T基因组 主要研究内容:作者采用PacBio HiFi、ONT ultra-long和Hi-C数据,通过hifiasm初步组装二倍体基因组的两个单倍型。随后利用Verkko和HiCanu的组装结果填补空缺区域及端粒区,最终每个单倍型被组装成17条染色体。其中分别有18.89和24.13 Mb区域此前未被成功组装。研究首次完成了亚洲梨代表品种‘砀山酥梨’(DS)和欧洲梨代表品种‘Max Red Bartlett’(MRB)的单倍型分型T2T基因组,为梨遗传变异机制提供了新见解,并将加
view more那些曾被称作"基因组暗物质"的迷雾,在Hi-C数据的星轨中逐渐显影。从第一节课的"什么是真正的T2T",到最后一场关于"T2T基因组特色分析"的探讨,我们共同完成了对生命完整性的温柔丈量。《T2T基因组学系列线上公开课》课程终章不是句点而是启动子——您构建的认知质粒正穿梭在学术宇宙,那些被激发的科研噬菌体将持续感染未知领域。 一、问答环节 1.四倍体,基因组接近2G,90条以上染色体,T2T有没有可能 答:如果是异源四倍体,比如油菜和棉花这种,是没有任何
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